鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學(xué)院設(shè)有生態(tài)工程系、生物技術(shù)系、機電工程、經(jīng)濟管理系、市政工程系、基礎(chǔ)部、中等職業(yè)教育處及其他部門，以下是具體名單，以供參考，可調(diào)整的，以學(xué)校最新公告為準。

一、學(xué)院

生態(tài)工程系

生物技術(shù)系

機電工程

經(jīng)濟管理系

市政工程系

基礎(chǔ)部

中等職業(yè)教育系

二、鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學(xué)院簡介

經(jīng)內(nèi)蒙古自治區(qū)人民政府批準成立鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學(xué)院、鄂爾多斯市政府投資建設(shè)、在鄂爾多斯農(nóng)牧學(xué)?；A(chǔ)上組建的一所高職院校，學(xué)院培育生態(tài)建設(shè)、環(huán)保應(yīng)用型人才是專業(yè)設(shè)置關(guān)鍵，本地化、面向西、服務(wù)全區(qū)，逐步建成以高等職業(yè)教育為主體的體系、中等職業(yè)教育作為補充、以成人函授和培訓(xùn)為補充的多元化辦學(xué)體系。

鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學(xué)院的前身是1978年在大拉特旗成立的鄂爾多斯農(nóng)牧學(xué)校，2011年，更名為鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學(xué)院。