福建生物工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院設(shè)有馬克思主義學(xué)院、中醫(yī)系、藥學(xué)系、保健食品部、康復(fù)保健系、健康管理系、公共基礎(chǔ)設(shè)施部等部門，以下是具體名單，以供參考，可調(diào)整的，以學(xué)校最新公告為準(zhǔn)。

1、學(xué)院

中醫(yī)學(xué)系、馬克思主義學(xué)院、藥學(xué)系、保健食品系、康復(fù)保健系、健康管理系、公共基建系

2、福建生物工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院簡介

福建生物工程職業(yè)學(xué)院是福建省教育廳直屬學(xué)院，培育生物醫(yī)學(xué)、健康食品、康復(fù)和護(hù)理、醫(yī)療技術(shù)、以健康管理高級(jí)技術(shù)人才為重點(diǎn)的公辦全日制高職院校。

學(xué)校前身為創(chuàng)建于1980年5月的福建醫(yī)學(xué)院；2005年5月，成立福建生物工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院。學(xué)校是中國醫(yī)學(xué)教育協(xié)會(huì)中醫(yī)藥技術(shù)傳承專業(yè)委員會(huì)主任委員單位、國家食品藥品監(jiān)督管理局技能大賽工作委員會(huì)主席單位，是國家首批“現(xiàn)代學(xué)徒制”試點(diǎn)學(xué)校之一、“1+X”養(yǎng)老職業(yè)技能等級(jí)證書試點(diǎn)學(xué)校，是“金陵康復(fù)醫(yī)學(xué)教育聯(lián)盟”成員，是國家中醫(yī)藥及保健服務(wù)標(biāo)準(zhǔn)研發(fā)和專業(yè)人才培訓(xùn)基地。